En la Rada de San Pedro, se permite el fondeo de tres buques al aguardo de muelle de carga. Existe una Rada auxiliar en la que se permite el fondeo de dos buques para operaciones de alije, provisión de combustible, etc.

Por sus características naturales posee un amplio frente sobre el Río Paraná y por el dragado ejecutado, su calado se encuentra entre los más profundos de los puertos de la zona. Su muelle tiene una longitud de 220 metros, y en el atracan para la carga, buques de hasta 228 metros de eslora. Posee un elevador principal de 24 silos y 12 entresilos, secadora, zaranda y playa de camiones propia. Una planta de silos subterráneos, compuesta por celdas ubicadas entre calles lindantes, permite la descarga y carga ágil de la mercadería, pudiendo ser transferida a cualquier destino, inclusive a embarques en camiones.

Cuenta además con 4 plataformas hidráulicas para la descarga de camiones.